明青学园高中部迎来新的学年，上杉达也（三ツ矢雄二 配音）和浅仓南（日高のり子 配音）顺利升入高三。在这新的征程伊始，棒球部的各位却迎来不大不小的风波。西尾教练突然病倒，之前的女经理推部。小南自然不会放任不管，她强烈要求校长让她重新担任棒球部的经理。与此同时，西尾教练也拜托早年毕业于明青学园柏叶英二郎担任代理教练。英二郎严肃冷峻，言语尖刻，被队员们称作魔鬼教练。伴随每一天艰苦严苛的训练，大赛的日子终于临近。通往甲子园的路上，达也和新田明男（井上和彦 饰）宿命的决战即将到来……                                    
                               本片根据漫画家安达充的同名原作改编，是该系列动画的第三部剧场版。